【Nature Genetics】康奈尔大学费章君\/Giovannoni课题组揭示了番茄泛基因组！

iPlants：  2019年5月14日，Nature Genetics在线发表了来自美国康奈尔大学费章君（Zhangjun Fei）和James J. Giovannoni课题组合作题为题为“The tomato pan-genome uncovers new genes and a rare allele regulating fruit flavor”的研究论文。该研究构建了栽培番茄及其近亲的泛基因组，其包括351Mb大小的序列和4,873个未被参考基因组捕获的蛋白质编码基因。其中观察到泛基因组中25.8％的基因表现出不同程度的存在/缺失变异PAV，突出了番茄的多样性遗传组成，具有未来改良的潜在用途。       由于在作物的驯化过程中有着强烈的人工选择，因此，许多农作物相对于野生祖先的遗传多样性减少。而在过去的一个世纪里，随着从适应当地环境的传统品种向统一的优秀的品系的转变，遗传多样性进一步受到减 ………………………………