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Cell | 高质量&高通量!马赛等开发单细胞测序新技术测定染色质潜力

BioArt  · 公众号  · 生物  · 2020-10-24 09:16
责编 | 兮细胞在分化发育过程受到多种不同层面的调控,其中染色质可及性是导致的基因表达变化的主要原因之一。由于细胞分化是一个动态且不同步的过程,研究这一过程中多变的调控机理变得尤其困难。2020年10月23日,美国Broad研究所的Aviv Regev团队和哈佛大学Jason Buenrostro团队的马赛博士在Cell上发表题为Chromatin potential identified by shared single cell profiling of RNA and chromatin的研究。该研究建立了一种新的实验技术,SHARE-seq。该技术能够实现在单细胞中同时高质量,高通量的检测基因表达和染色质可及性。在该方法中,染色质中的开放区域先被Tn5标记,RNA再反转录成具有biotin的cDNA。通过多轮的indexing,使得每个单细胞中的RNA和染色质均同时被独特的DNA barcode标记。最后通过链 ………………………………

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