微生物组学从入门到精通（7）：数据去宿主

第七节获取完整视频，请联系文末客服扫描二维码添加客服微信数据去宿主目的： 对于取自于宿主（动物或人）身体某部位或排泄物的样本数据，去除来源于宿主的DNA序列工具：bwa或bowtie2、samtools、bedtools数据库：宿主（例如人基因组序列）的基因组序列库操作原理：将原始数据质控预处理后的high quality reads data比对到宿主基因组序列，并将比对上的序列进行剔除，剩余非宿主来源的微生物DNA序列即clean data进行下游数据分析。工具的安装： 1）bowtie2安装 2）samtools，bedtools安装 3）宿主基因组（例如人基因组）下载建库 4)比对并提取KneadData源代码安装：单端数据双端数据本系列课程安排本系列往期链接：点击即可查看微生物组学（1）微生物组学（2）：分析流程概述微 ………………………………