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为啥他们会分析单细胞测序的tSNE图?这篇5.201分的SCI文章到底讲了个什么故事……

实验万事屋  · 公众号  · 科研  · 2021-06-25 08:20
今天我们就把这篇5.201分的文章,认真地来一步步看看,他们到底都做了些啥……首先他们寻找的是差异表达基因(DEGs),这一步其实就是通过已有的GSE数据来进行差异基因的分析,获取其中PVASCs中高表达的基因。从结果来看,也就是通过韦恩图进行分析的,寻找皮下 (Sub)、腹部 (Ab) 和血管周围 (Pv) ASC 之间差异的基因,特别是PVASCs中高表达的基因:这其实就是归纳法中,米勒五法的求异法……而找到的这个差异基因TBX20到底有什么作用呢?这个确实也不清楚,所以他们调用了别人的单细胞测序数据:这个单细胞测序并不是他们做的,否则就真的太卷了……他们用别人2019年发表的数据,进行了分析,并且对于PVASCs的细胞亚群,进行了分类。这个图就是t-SNE图,可能不太好 ………………………………

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