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盆友,想分析RNA Seq的二代测序数据?那用这个8.673分的神奇笔记本就行了……

实验万事屋  · 公众号  · 科研  · 2021-01-24 20:28
要怎么样来分析网上能挖掘的Seq数据呢?说实话,估计你们也就知道个TCGA……但TCGA都是肿瘤数据,如果要分析其他的就比较难了。所以你们可以使用生物朱比笔记本……这个工具其实早几年就有了,发在8.673分的Cell Syst上,直接搜索想要找的关键词就行了:然后选择你想要分析的二代测序数据:基本分析,就是PCA和热图聚类等等……当然,可以把剩下的全都勾选上,做个差异表达啊,做个GO分析啊等等,都行……甚至因为是RNA Seq,所以甚至还能寻找上游的转录因子。随便按照你的要求选择一下样本分组,这个和GEO2R差不多:然后对各个结果的参数进行设置:点击生成就行了:最终结果就是个笔记本,会记录所有分析数据的笔记本:比如差异基因的数据以及样本数据:3D ………………………………

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