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快上车!综合数据库footprintDB同时搞定转录因子与靶基因查询

挑圈联靠  · 公众号  ·  · 2020-12-21 08:37
一文学会footprintDB数据库使用方法嗨,小伙伴们大家好!这里是每周一弘毅专栏,我志向用小小文字助力你的SCI发表之路。本周继续转录因子话题,给大家带来转录因子综合数据库footprintDB,跟着弘毅的脚步一起来看看吧~!一、数据库概览进入footprintDB主页(http://floresta.eead.csic.es/footprintdb/index.php),可见该数据库最新版本于2020年12月2日更新,目前收录来自包括JASPAR在内的19个数据库的9350个转录因子、13682个DNA motifs和35058个DNA结合位点数据,点击侧边栏Databases可分别查看19个数据库的版本信息及其包含的转录因子数据条目统计信息。在侧边栏提供Keywords和Sequences两种检索方式。页面下拉,可见该数据库提供两种功能,已知蛋白预测/查找DNA binding sites或DNA motifs,已知DNA bindi ………………………………

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