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Cancers 6+| 胰腺癌粘蛋白预后分析

生信人  · 公众号  · 生物  · 2020-11-30 07:50
今天跟大家分享的是发表在Cancers(IF: 6.126)上的一篇文章。由于缺乏有效早期诊断标志和治疗手段,胰腺癌患者往往预后较差。本篇文章主要基于对粘蛋白基因表达的无监督聚类,构建胰腺癌粘蛋白基因预后标志,是一篇基础的生物信息学文章。生信人提供新颖、正规、可复现的粘蛋白生信分析服务扫码联系基于无监督层次聚类识别TCGA胰腺癌样本的粘蛋白表达相关预后特征1.数据和方法(1)22个编码O-糖蛋白的黏蛋白基因:膜结合黏蛋白和分泌黏蛋白。(2)TCGA中胰腺癌患者的基因表达数据和预后数据。(3)GEPIA数据库中正常胰腺组织的基因表达数据。(4)GSE28735中胰腺癌和癌旁组织中基因表达数据。(5)Protein Atlas数据库中胰腺癌患者黏蛋白的蛋白质表达水平。2.黏蛋 ………………………………

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