专栏名称: 生物极客
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Science| DISCOVER-Seq 探究基因编辑体内脱靶效应

生物极客  · 公众号  · 生物  · 2019-04-21 23:35
基因编辑诱导目标位置的DNA损伤,但也会影响非目标位点。目前的非目标发现方法使用纯化的DNA或特定的细胞模型,但不能在体内直接检测。近期在Science发表了DISCOVER-Seq(原位Cas离靶发现和测序验证),这是一种普遍适用的无偏离靶鉴定方法,利用细胞和生物体中DNA修复因子的募集。跟踪MRE11的精确募集揭示了具有单碱基分辨率的细胞中Cas活性的分子性质。DISCOVER-Seq允许对新编辑工具进行表征。在细胞系和患者来源的诱导多能干细胞中,以及在小鼠腺病毒编辑过程中,可以识别非靶标,为在治疗基因组编辑过程中在个体患者基因型中原位发现非靶标铺平了道路。研究人员研究了一组DNA修复蛋白通过Chip-seq识别化脓性链球菌Cas9靶位点的能力。研究人员MRN复合体的MRE11亚单位 ………………………………

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