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审稿人质疑生存分析分组不正确?这是我见到最有效的解决办法!(附代码)

解螺旋  · 公众号  · 医学  · 2021-04-18 12:00
通过best Separation快速获取最佳生存分组大家好,我是阿琛。在生存分析过程中,如何对患者进行分组,以获得一个最佳的分析结果,往往是一个值得考虑的问题。在常见的分析过程中,一般存在两种选择:第一种是根据表达的中位值进行分成高表达组和低表达组;第二种则是使用最佳的截断值,即cut-off值,获得最低的P值。然而,尽管第一种分组方法相对比较简单,但是其最终的分析结果往往并不理想,无法得到有意义的结果。因此,根据最佳的截断值来获得最佳的结果是十分必要的。下面,我们来看下两种分组方法的分析过程。1. R包和数据准备1.1 R包安装与读取#镜像设置options("repos"= c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))options(BioC_mirror="http://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")inst ………………………………

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