收藏就是雪藏，占有不是拥有。GZ08差异分析笔记分享。

受果子老师之邀，结合自己的幕布版学习笔记，整理GZ08教程的详细读后感。说实话，接受这个任务的第一感受是“诚惶诚恐”，谨将自己学习过程中的收获感悟总结如下。一、课程脉络这个课程共分三个层次9节课，层层递进、环环相扣。1-4节是基础分析，包括GEO数据的limma分析与作图、RNA测序数据的Deseq2分析与作图的内容。5-7节为提升内容，包括配对样本与多分组样本的分析处理、edgeR包的分析方法。8-9是野蛮玩法，分别是“手动”算差异基因、对基因集做差异分析的内容。二、学习收获A-关于生信分析：什么是清洁数据(tidy data)？行是观测，列是变量。观测是一个大的整体，而变量是整体中的元素。其他的就是相对的脏数据了。比如，脏数据的行是基因，列是样本， ………………………………