Genome Research | 邵振团队开发用于多样本ChIP/ATAC-seq数据分组定量比较的新计算模型MAnorm2

责编丨兮近日，Genome Research在线发表了中国科学院上海生科院营养健康研究所计算生物学重点实验室（马普伙伴计算生物学研究所）邵振课题组的方法学论文MAnorm2 for quantitatively comparing groups of ChIP-seq samples，报道了其开发的新一代MAnorm2计算模型。该模型能够对多样本ChIP/ATAC-seq数据按照特定标签分组进行统计建模和组间定量比较，可靠地在样本组层面鉴定组间显著差异的ChIP/ATAC-seq信号。染色质免疫共沉淀测序（ChIP-seq）实验被广泛用于刻画转录因子结合和组蛋白修饰的全基因组分布。比较来自不同细胞类型的ChIP-seq样本是刻画细胞分化和病变过程中动态转录和表观调控的关键基础。2012年，邵振与张一婧等合作在Genome Biology发表了用于两个ChIP-seq样本之间进行一对一定量 ………………………………