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单基因,预后+耐药生信分析,7+思路学起来!

生信人  · 公众号  · 生物  · 2024-05-23 07:00
今天分享文章题目是Novel prognostic biomarker TBC1D1 is associated with immunotherapy resistance in gliomas,一篇今年3月发表在Frontiers in Immunology(if:7.3)杂志上的文章。        本研究基于公共数据在胶质瘤中筛选到一个关键基因(TBC1D1),该基因可作为胶质瘤预后标志物,且可降低肿瘤免疫治疗的有效性。通过靶向TBC1D1可增强免疫治疗疗效,提高患者预后,贴合临床价值。     个性化方案定制思路    单基因不加大量湿实验很难发了,这篇文章注重生信分析思路,轻湿实验,值得我们学习借鉴,我们一起来看看吧~         主要研究结果   鉴定TBC1D1是胶质瘤预后和治疗耐药相关的显著标志物      首先,从CGGA和TCGA数据库筛选总生存期相关的基因,二者取交集供筛选OS相关基因。之后对药物治疗反应者中,筛选到有4736个基因显著上调。进一步使用GSEA对上调基因 ………………………………

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