STTT | 同济大学房健民等团队开发新的方法，实现新抗原设计

iNature新抗原疫苗是个体化肿瘤治疗中最有效的免疫疗法之一。目前新抗原疫苗的免疫原设计通常基于全基因组测序(WGS)和生物信息学预测，这些预测侧重于预测肽与MHC分子之间的结合亲和力，而忽略了其他肽呈递相关步骤。这可能导致较高的预测准确度与较低的临床有效性之间的差距。2023年10月18日，同济大学房健民及复旦大学Qiu Tianyi共同通讯在Signal Transduction and Targeted Therapy（IF=39）在线发表题为“Neo-intline: integrated pipeline enables neoantigen design through the in-silico presentation of T-cell epitope”的研究论文，该研究设计了一个集成的In-silico管道Neo-intlin，从肿瘤样本的SNPs和indel开始，通过集成的计算模型来模拟肽在体内的呈现过程。在TESLA基准数据集和临床验证的新抗原上的验证表明，Neo-inline在样本水平和黑色素瘤水平上都优于当前最先进的工具。此外，以 ………………………………