SRA转换居然可以有这个操作

最好的学习方式就是比猫画虎，做例题。不管是想重复别人数据想多学两个技能，还是做自己的课题，都需要从NCBI上下载数据。NCBI上下到的数据是SRA格式。需要转换成fastq格式，才能进行后续的分析。但是，据传说，甭看NCBI算是天下第一大数据库，SRAtookit的说明文档可以说是丑的一比，看半天也不知道该怎么动手。网上搜它的使用教程，百度出来的结果，包括很多生信公众号教程里给的倒挺简洁：    单端测序：fastq-dump ****.sra    双端测序：fastq-dump --split-3 ****.sra果真如此吗？键入命令：fastq-dump  -h，显示出来的参数可是一大堆一大堆啊。那么多参数，都是没有的吗？是对是错，先拿来试试。运行命令：/home/gwli/software/sratoolkit.2.8.2-1-centos_linux64/bin/fastq-dump --gz ………………………………