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Seurat Weekly NO.09 ||向量化调参

生信菜鸟团  · 公众号  · 生物  · 2021-02-04 22:34
天子呼来不上船,自称臣是菜鸟团。在这里,与国际同行一起学习单细胞数据分析。在数据分析过程中,往往需要看不同的参数下的数据表现,也往往需要循环某个列表(基因集或者分组),这时候向量化测试效率就比较高了。向量(vector)是R编程里最底层也是最核心的结构,并且从广泛意义上的数据类型而言,R中的矩阵和数组甚至是列表都是向量。提升代码效率的有效途径便是向量化(vectorize),即将运算符或者函数作用在向量的每一个元素上的一种理念。多个聚类的resolution参数:library(Seurat)library(SeuratData,lib.loc = 'F:\\EE\\software\\R\\R-4.0.2\\library')library(pbmc3k.SeuratData,lib.loc = 'F:\\EE\\software\\R\\R-4.0.2\\library')   library(clustree,lib.loc = 'F:\\EE\\software\\R\\R-4.0.2\\library')    ………………………………

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