数据中心化、scaling以及转换

今天给大家分享一篇关于代谢组中数据预处理（中心化、缩放和转换）的文章，但是同样适用于其他类似数据。Berg, Robert A van den, Huub CJ Hoefsloot, Johan A Westerhuis, Age K Smilde, and Mariët J van der Werf. “Centering, Scaling, and Transformations: Improving the Biological Information Content of Metabolomics Data.” BMC Genomics 7 (June 8, 2006): 142. https://doi.org/10.1186/1471-2164-7-142.代谢组数据中不同代谢物浓度差异高达5000倍，与代谢物的生物学相关性不成比例。但是数据分析方法是无法区分的。通过数据预处理可以纠正这个问题。作者将代谢物数据的变化分为induced biological variation和induced biological variation的变化：induced biological variation：代谢物浓度在数量级上存在差异;例如，信号分子的平均浓度远低于ATP这类含量很 ………………………………