Nat Methods | 一箭双雕——利用纳米孔测序同时获取染色质可及性和甲基化信息

撰文 | 阿童木责编 | 兮 近年来随着DNA测序技术的蓬勃发展，蛋白质结合位点的高通量鉴定、染色质可及性（chromatin accessibility）及甲基化状态分析等检测技术不断涌现，其中很多技术（如DNase-seq和ATAC-seq等）依赖于开放性染色质对转座酶等的敏感性【1,2】。在这些新技术中，NOMe-seq（nucleosome occupancy and methylome sequencing）能够利用外源性M. CviPI GpC甲基转移酶标记基因组可及性区域，结合亚硫酸氢盐转换，NOMe-seq能够同时检测内源性胞嘧啶甲基化和核小体开放性状态【3】。 纳米孔测序（Nanopore sequencing, 又称第四代测序）是近年来兴起的新一代单分子测序技术，具有测序读长（reads）长（>150 kb），速度快，测序数据实时监控，机器方便携带等优点。之前研究已证明纳米孔 ………………………………