代码分析 | 单细胞转录组质控详解

前言NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析 （Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析 （ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析 (重磅综述：三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程 （原理、代码和评述）)、DNA甲基化分析、重测序分析、GEO数据挖掘（典型医学设计实验GEO数据分析 (step-by-step) - Limma差异分析、火山图、功能富集）等内容。在前期处理单细胞转录组数据中，Quality Control（QC）是至关重要的一环（Hemberg-lab单细胞转录组数据分析（三）- 原始数据质控），直接关系到后期分析数据的可靠性。在单细胞转录组分析中，我们发现不同QC造成的结果也是略有差异，比如细胞周期、线粒体相关基因和核糖体相关基因等均会对下游数据分析造 ………………………………