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EBioMedicine|泛癌miRNA基因突变

生信人  · 公众号  · 生物  · 2020-10-26 08:27
今天跟大家分享的是今年十月份发表在EBioMedicine(IF: 5.736)上的一篇文章, 主要是基于TCGA中的Pan-cancer数据对miRNA基因体细胞突变进行分析,是一篇比较基础的Pan-cancer分析文章,简单套路有条理。Pan-cancer中miRNA基因的体细胞突变分析本篇文章主要基于TCGA中超过10000例样本的全外显子组测序数据,对miRNA基因的体细胞突变进行分析,发现miRNA基因可以在Pan-cancer和/或特定癌症中发生过突变,并对这些过突变的miRNA基因与相应miRNA表达,生存时间,分期和分级等临床因素之间的关联进行分析。1.数据(1)TCGA中基于四种突变算法(Mutect2,Muse,Varscan和SomaticSnipper)处理后的全外显子测序的体细胞突变数据。主要对miRBase数据库中注释的1918个miRNA基因编码区域的突变数据进行分析, ………………………………

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