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专栏名称: 宏基因组
宏基因组/微生物组是当今世界科研最热门的研究领域之一,为加强本领域的技术交流与传播,推动中国微生物组计划发展,中科院青年科研人员创立“宏基因组”公众号,目标为打造本领域纯干货技术及思想交流平台。
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Cytoscape制作带bar图和pie图节点的网络图

宏基因组  · 公众号  ·  · 2019-06-24 00:00
采用cytoscape制作带bar图和pie图节点的网络图作者:中科院微生物所 陈亮博士本教程旨在告诉大家如何使用cytoscape根据Node信息表格制作带有barplot信息节点的网络图。以安装文件夹下的样例数据为例。软件安装(装过请跳过)Java安装Cytoscape的使用需要依赖Java环境,根据不同的版本选择相应的Java程序,Cytoscape 3.4.0使用Java8,不再支持Java6和Java7。不同操作系统选择相应的Java版本下载安装,详见 https://www.java.com/zh_CN/ 。Cytoscape安装Cytoscape 同样有适用于不同操作平台的版本,安装方法不尽相同。所有的版本都可以从 http://cytoscape.org/ 网站下载。Windows系统下双击exe应用程序开始安装;Linux和Mac OS X系统运行sh文件安装。打开Cytoscape本文以Cytoscape_v3.4.0为例,不同版本操作类似,略有不 ………………………………

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