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单细胞肿瘤驱动基因研究思路

生信人  · 公众号  · 生物  · 2019-08-17 00:02
整合单细胞遗传学和转录组分析揭示慢性淋巴细胞白血病的新驱动基因Integrated single-cell genetic and transcriptionalanalysis suggests novel drivers of chroniclymphocytic leukemia(GR)通过对包括慢性淋巴细胞白血病(CLL)在内的大量肿瘤进行基因组测序,可以发现肿瘤内部的遗传异质性。虽然大量DNA水平的数据为克隆异质性的特征化提供了一个框架,但癌细胞的表型无疑受到基因组成和基因表达的双重控制,因此,理解这种关系要求在单细胞水平上整合基因和转录信息。今天这篇文章中研究人员为了更准确地对CLL进行亚克隆鉴定、确定系统发育关系和基因型与表型的关系,他们开发了从5个CLL样本的数千个单细胞中检测DNA和RNA的靶向突变的方法。通过明确系统发育关系,研究人员鉴定出突变的 L ………………………………

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