多因子降维法MDR分析GxG, GxE交互作用

欢迎关注”生信修炼手册”!尽管通过GWAS能够识别到一些与疾病存在关联的SNP位点，然而很多复杂疾病的遗传因素并不能被GWAS分析的结果完全解释，这一现象称之为遗传力缺失missing heritability。造成遗传力缺失的原因有有很多种，其中有两种因素被认为是最可能和这一现象相关的基因和基因之间的相互作用，Gene-Gene interaction基因和环境之间的相互作用，Gene-Environment interaction第一种用GxG表示, 第二种GxE表示。研究相互作用有两种方式，第一种是基于回归分析的方法，在回归方程中引入自变量间的相互作用；第二种方法是机器学习，主流的方法是多因子降维法multifactor dimensionality reduction简称MDR, 该方法中的因子为具有交互作用的变量，而维度指的是交互作用因子的组合，比 ………………………………