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遗传所屠强研究组开发Decode-seq方法显著提高差异表达基因分析的准确性

生信宝典  · 公众号  · 生物  · 2020-03-24 10:30
转录组分析的正确姿势(第三版)前言NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析 (Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这)、ChIP-seq分析 (ChIP-seq基本分析流程)、单细胞测序分析 (重磅综述:三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程 (原理、代码和评述))、DNA甲基化分析、重测序分析、GEO数据挖掘(典型医学设计实验GEO数据分析 (step-by-step) - Limma差异分析、火山图、功能富集)等内容。鉴定差异表达基因是许多生物医学研究项目的基础步骤,利用转录组进行差异表达(Differential Expression, DE)分析是目前最主流的方法,得到了广泛应用。例如,两个常用于转录组DE分析的算法 edgeR 和 DESeq2 已经被引用了超过上万次。  在DE分析中,如果使用的 ………………………………

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