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基于文献挖掘与分子对接技术的抗新型冠状病毒中药活性成分筛选

中草药杂志社  · 公众号  · 药品  · 2020-02-18 07:57
摘 要:目的  采用文献挖掘与分子对接技术相结合的方法筛选潜在的中药抗新型冠状病毒(2019-nCoV)活性成分。方法 通过近期国家及各权威机构发布的防治新型冠状病毒疾病(COVID-19)方案的中医方剂以及常用抗病毒中药筛选候选中药,通过TCMSP、CNKI及PubMed搜集整理候选中药活性成分。2019-nCoV 3CL水解酶(Mpro)蛋白结构由上海科技大学饶子和院士团队提供。采用AutoDockVina进行分子对接。结果  通过文献查阅与处方筛选共得到11个高频使用抗病毒待研究中药,通过TCMSP及文献查阅整合得到469个候选活性成分。通过分子对接得到结合能<−33.44 kJ/mol的成分41个,其中柴胡皂苷(E、B1、D、F、B2、C2、A)、甘草酸等多种成分与2019-nCoV 3CL水解酶蛋白均有较好的亲和力。候选药 ………………………………

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