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肿瘤外显子数据处理系列教程(九)拷贝数变异分析(不同软件的比较)

生信菜鸟团  · 公众号  · 生物  · 2019-12-09 21:47
写在前面上一节我们用 GATK 的 CNV 流程分析了拷贝数变异,系列教程见:肿瘤外显子数据处理系列教程(一)读文献并且下载测序数据肿瘤外显子数据处理系列教程(二)质控与去接头肿瘤外显子数据处理系列教程(三)比对肿瘤外显子数据处理系列教程(四)比对结果的质控肿瘤外显子数据处理系列教程(番外篇)bam文件载入igv可视化肿瘤外显子数据处理系列教程(五)GATK的最佳实践肿瘤外显子数据处理系列教程(六)vcf文件的注释及ANNOVAR的使用肿瘤外显子数据处理系列教程(七)maftools可视化肿瘤外显子数据处理系列教程(八)不同注释软件的比较(上):安装及使用肿瘤外显子数据处理系列教程(八)不同注释软件的比较(中):注释后转成maf文件肿瘤外显子 ………………………………

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