孟佳课题组|Peak Calling软件exomePeak以及exomePeak2使用指北

前面我提到了有学员提问： 新的ngs流程该如何学习之m6A学习大纲，所以我给了他优秀学员想要MeRIP-Seq/m6A-seq教程，但是他并没有主动给我投稿，不过我们的转录组授课讲师也感兴趣了这个技术，想丰富一下课程内容，所以开启了这个系列学习哈！下面是转录组讲师的投稿使用这个软件的原因主要在于它是专门针对6a-Seq数据的甲基化处理软件。这款软件输入样本的bam文件，一个函数就可以完成peak calling以及差异peak分析，可以说是非常简单方便了；缺点就是软件自发表后，更新维护非常少，发表完了就完事了。引用率还行，目前很多可用的专门针对RNA 甲基化分析的软件和包，大多数都会借鉴一部分ATAC-Seq和ChIP-Seq分析pipeline。# 安装软件，服务器 conda环境conda install -c bio ………………………………