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专栏名称: 华大集团BGI
拥有世界一流的科研队伍,开展一系列重要动植物、人类健康、生物能源的基因组研究,致力于人类健康服务事业和科技应用领域的发展。
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基因头条 | NBT:新开发单细胞测序数据分析算法;NG:72家机构联手,最大规模人遗传与肠菌分析发布

华大集团BGI  · 公众号  · 生物  · 2021-01-20 10:26
科研进展1、NBT:新开发单细胞测序数据分析算法Nature Biotechnology,为解决大型单细胞RNA测序数据分析时遇到的挑战,德州大学MD安德森癌症中心研究人员开发了一种新的单细胞测序数据分析算法CopyKAT(copy number karyotyping of aneuploid tumors,非整倍体肿瘤的染色体核型分型),可通过单细胞RNA测序数据可靠地区分癌症和正常细胞,使用基因表达数据来寻找非整倍性或存在异常的染色体数,还有助于识别癌细胞内的不同亚群或克隆。通过将结果与全基因组测序数据进行比较,来对该算法进行基准测试,该数据在预测拷贝数变化方面显示出很高的准确性。在来自胰腺癌、三阴性乳腺癌和间变性甲状腺癌的另外三个数据集中,研究表明CopyKAT也能够准确区分混合样本中的肿瘤细胞和 ………………………………

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