西湖大学常兴/原发杰最新Mol Cell

编者按目前的碱基编辑器(BEs)使用DNA脱氨酶，包括胞苷BE (CBE)中的胞苷脱氨酶或腺嘌呤BE (ABE)中的腺嘌呤脱氨酶，以促进过渡核苷酸取代。将CBE或ABE与糖基酶结合可诱导有限的翻转突变。尽管如此，对能够产生替代突变类型(如T>G校正)的BEs的关键需求仍然存在。2024年2月19日，西湖大学常兴及原发杰共同通讯在Molecular Cell 在线发表题为“Protein language models-assisted optimization of a uracil-N-glycosylase variant enables programmable T-to-G and T-to-C base editing”的研究论文，该研究利用蛋白质语言模型辅助优化尿嘧啶-N-糖基酶变体，使可编程的T-to-G和T-to-C碱基编辑成为可能。该研究利用预先训练的蛋白质语言模型来优化尿嘧啶-N-糖基化酶(UNG)变体，该变体对胸腺嘧啶(eTDG)具有改变的特异性。值得注意的是，在两轮测试不到50个顶级变异后，超过50%的酶活性提高了1.5倍以上。当eTD ………………………………