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转录组测序看基因融合事件的临床意义

生信技能树  · 公众号  ·  · 2020-01-04 10:18
通常,基因融合会产生基因融合转录本和嵌合蛋白产物,它们已被用作治疗的靶标。众所周知的例子是靶向BCR-ABL1基因融合的格列卫(Imantinib)和靶向EML4-ALK基因融合的克唑替尼。所以很多癌症研究是关于融合基因的,比如发表在3分杂志:Cancer Biol Ther. 2014; 题目是:Recurrent FGFR3-TACC3 fusion gene in nasopharyngeal carcinoma.  , 值得注意的是  FGFR3-TACC3  的基因融合事件,非常出名的!大家随便搜索一下就知道,好几个CNS文章报道过它,在TCGA的融合基因数据库也可以搜索到它,存在于多种癌症。RNA-seq测序因为早期发表在6分杂志:J Pathol. 2013 Oct; 已经提到了其实验室的C666-1细胞系有UBR5-ZNF423 基因融合事件,所以本研究作者加上了那已经发表的两个细胞系,以及自己医院的12个病人 ………………………………

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