无参考基因组的转录组测序分析流程

周末更新,实属不易,若是有想听我们进行生物信息学培训的组织可微信联系.医院相关体系可以免费.有想听在线课程的,拉到最后点击阅读原文.下边上干货.1. 分析流程： 2. 分析步骤2.1 数据预处理，质控过程，与有参考的转录组分析一致 2.2 UniGene拼接目的：将预处理后reads进行拼接，得到拼接结果。 原理： 应用 de Bruijn graph path 算法对reads进行denovo拼接；对上一步的拼接结果，再用Hamilton Path算法拼接。 结果：UniGene序列，UniGene统计信息，序列长度分布图 2.3 数据库注释 目的：对拼接得到的UniGene进行功能注释 原理：通过blast+算法将拼接得到的UniGene序列与数据库进行比对 结果：比对结果表格，物种分布统计和Evalue分布统计  2.4 UniGene表达分析目的：UniGene定量分析。 原理：以UniGene为reference，分别将每个样本的reads进行reference mapping ,从而得 ………………………………