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实验和检测技术带来的高假阳性乌云:6mA是否真的在哺乳动物中广泛存在?

生信宝典  · 公众号  · 生物  · 2020-02-28 09:40
去年6月,哈佛医学院Eric L. Greer研究组发表了题为Sources of artifact in measurements of 6mA and 4mC abundance in eukaryotic genomic DNA的文章,重点探讨了常用修饰检测技术在检测6mA和4mC等核酸修饰时可能引入的误差,并从实验操作、系统误差、数据分析等方面展开了讨论[1]。作者通过优化检测方法重新核验了部分已发表的DNA修饰数据(包括Eric Greer 本人2015年在Cell上发表的线虫6mA数据[2]),发现已有的研究报道中确实存在假阳性结果,而由此得出的生物学推论也需要更谨慎的论证。该工作提出的观点对于关注核酸修饰研究领域发展的学者们有重要参考意义。DNA修饰已被报道可参与多种原核、真核生物的重要生命过程,包括基因转录、X染色体沉默、基因印记等。根据现有报道,在哺乳动 ………………………………

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