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Seurat Weekly NO.08 || Seurat 交互系统

生信菜鸟团  · 公众号  · 生物  · 2021-01-28 19:51
天子呼来不上船,自称臣是菜鸟团。在这里,和国际同行一起学习单细胞数据分析。数据可视化是数据分析中关键的一步,相比于静态绘图,交互(界面)图可以给我们更多的调节空间。单细胞数据分析中往往需要用不同的参数来可视化细胞图谱或者基因表达特征,Seurat也中有相关的交互绘图功能。而随着单细胞技术的普及,很多刚开始接触编程或者没有接触过编程的朋友也开始有了分析单细胞数据需求,于是有了SeuratV3Wizard这样的完全交互的Seurat平台。在Seurat V4 版本中,也官方地提出了其交互平台(Shiny app):azimuth 并且内置了PBMC的参考数据集,可以在线分析和注释。本期Seurat  weekly 就和大家探索一下Seurat 的交互系统。在Seurat中交互的参数一般是interactive,我们 ………………………………

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