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临床生信之家新功能-6:TCGA泛癌分析

弗雷赛斯  · 公众号  · 科研  · 2021-01-09 14:32
近年来,多维组学联合分析成为大趋势,经常出现在高分文章中。而“泛癌” pancancer研究尤其火热,泛癌就是在研究当下的癌种后,再扩大范围到其他癌种,可以是所有肿瘤的大泛癌,也可以是诸如呼吸系统、消化系统肿瘤的小泛癌。总之,想要文章有深度,发现某个基因、biomarker,千万别完,继续分析该发现在其他病种中的特征,如果一致就说这个发现具有广泛性,不一致就说不同病种有异质性。在pubmed中搜一个“pancancer”,就可以发现近年来相关文献发表量在逐年递增。于是,为了跟上时代的潮流热点,我们新增泛癌分析工具。比如来一个多个肿瘤组织和正常组A2M基因的表达情况,如下图,与正常组相比一些肿瘤中呈现低表达,一些呈现高表达,由于TCGA数据库中 ………………………………

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