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SwissSimilarity:基于配体的虚拟筛选在线服务器

生信杂谈  · 公众号  ·  · 2017-12-01 14:29
SwissSimilarity(http://www.swisssimilarity.ch)是Swiss系提供的一个基于配体的虚拟筛选在线服务器。主要的用途我觉得包含几个方面,1)一个是比如有一个小分子,需要找寻它潜在的靶标位点,作为一个找靶。2)另外一个是你有一个已知的靶点小分子,但是它的性能可能不好,你需要对其母环改造,那么可以进行骨架跃迁。3)还有一个应用就是你有一系列已知作用靶标的化合物,想找类似物进行合成优化,那么也可以进行LBVS进行初筛。当然限于我的知识面的原因,可能还有其他许多应用欢迎小伙伴们提出。虚拟筛选(Virtual screening, VS)一般可以分为受体基础(RBVS)和配体基础(LBVS)两种方法,其中RBVS又可以称做结构为基础的虚拟筛选(SBVS),通常是对目标大分子进行对 ………………………………

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