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[原创]基因家族分析与可视化 - 基本技能啊!你还不会?

生信札记  · 公众号  ·  · 2020-02-08 11:33


最近看到不少人推基因家族分析课程,Emmm....

想想基因家族分析本身应该是所有人都能轻松掌握的简单技能

也不需要Linux,也不需要虚拟机,也不需要输入命令

那我也推一泼之前放到腾讯课堂的讲演,作为呼应。


注意-热身课程-完全免费


一键出图!


整体上,课程讲演的主要内容:

具体见文末美图,

1) 界面化,轻松提取全基因组序列

2) 无需一行命令,也完全不用脚本,获取目标基因家族成员序列

3) 本地完成MEME保守Motifs挖掘

4) 可视化保守结构域的结果

5) 高效且快速,无个数限制,点击即可完成的基因结构图(内含子-外显子等)

6) 快速组合进化树,一键松松展示进化树+MEME+基因结构+保守结构域

7) 一键基因定位在染色体上,查看基因分布

8) 纯粹的windows下界面化,开展全基因组的基因共线性分析,确定家族成员的进化来源

9) 完美地可视化多基因组共线性关系结果

10) 简单快速的实现Circos图的绘制(无需虚拟机,无需perl,纯界面)

11) 本地高效快速的界面化dn/ds批量计算

12) 高效完成启动子顺势作用元件分析与可视化

13) ....无限的可能,需要的是你的灵活运用


写在前面

TBtools不断地更新,慢慢地能够完成越来越多生信下游数据分析中相对繁琐的小人物。与此同时,TBtools也不断推出了让所有人都能完美绘制一些发表级的图片的功能。机缘巧合之下,有不少做基因家族分析的朋友使用了TBtools,并让我慢慢发现,目前TBtools完全可以让所有人在任何操作系统(windows,mac,Linux)下完成所有基因家族数据分析以及可视化。这是一件有趣的事情。

为什么要推出基因家族数据分析系列讲演

我曾经撰写过一些关于TBtools在基因家族分析中应用的文章,也推过一篇主题大致为任何人都能完成基因家族数据分析 的推文。于是不少朋友希望我能过推出系列讲演,以详细阐述基因家族分析如何开展。
我知道,目前市面上已然有一些基因家族数据分析课程。但我个人以为,作为TBtools的作者,在如何让所有人在使用TBtools的情况下,短时间内掌握并完成基因家族分析的这个事情上,我应是相对擅长(当然,也有不少朋友其实比我还用的好)。目前我也参与了数篇基因家族分析文章的部分工作,尤其在图片的可视化上,有一定的经验。总结一句话:
我希望通过这个课程,让基因家族分析成为真正的毫无门槛,零难度的存在!

课程整体信息如下

适用人群

1.对基因家族分析感兴趣的所有人
2.接触了分子生物学,但对生物数据分析不是太了解的所有研究生

常见市面课程的不足之处

目前为止,所有基因家族分析的方式,都有不足之处:
1.Linux - 掌握难度过高
2.Windows+虚拟机(即低性能的Linux) - 可能安装都有困难
3.必须进行命令行操作,无法避免的命令的输入与记忆!

通过这门课程,你将
  1. 纯粹界面操作!不需要输入一行命令,不需要虚拟机,

  2. 在windows下即可完成所有分析(Mac或者Linux也行)

  3. 高效而完美的可视化结果



点击下方链接,跳转课程主页
https://ke.qq.com/course/338062?tuin=72ed3eb
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