基于GFF3/GTF文件-批量提取启动子或CDS序列-任何人都可以

写在前面Emm....最近确实是忙到晕头转向，所以一直没有继续写。今晚似乎还有大半个小时的时间，便尝试写写。这篇推文应是 《-零命令行-生信下游数据分析》的第五贴，主题定为基于gff3/gtf从基因组序列中批量调取序列。伴随高通量测序的普及，越来多的物种基因组得到测序，为从事响应物种的研究工作者提供了极大的便利，但也带来了不少数据提取和整理的烦恼。有一句名言说的好，如下：海量的生物数据，如果无法解读或利用，那么不是生物信息，而是占据硬盘的垃圾。--CJ而利用这些数据的其中一个常见的热点就是，序列的提取。主要原因是：有些基因组确实只提供了基因组序列和注释文件有时候我们需要基因组网站所没有发布的部分，如某些基因的启动子区域这个时候，就需要自己进行序列提取正文这篇推文主要讲三个模式，分别对应三 ………………………………