GO和KEGG分析最常用的工具就是DAVID数据库了，windows下操作，简单方便。但是可视化做的不好，后续还要自己画图；而且它的结果是一堆表格，整理起来比较麻烦；如果样本较多，一组一组的基因去提交分析也很繁琐。R包clusterProfiler在网上备受好评，甚至被成为“神包”。主要有两大特点，一是非常好用，代码非常简短，仅仅数行就完成分析；二是方便可视化，内有多个作图函数可供选择。1. GO分类（以“BP”为例）library(DOSE)load("geneList.rda")gene 2]ggo groupgo=summary(ggo)结果如下：2.GO富集（以“CC”为例）ego qvalueCutoff=0.1, readable=TRUE)enrichgo=summary(ego)cnetplot(ego, categorySize = "pvalue", showCategory = 5)结果如下：3. KEGG富集kk qvalueCutoff = 0.2, readable = TRUE)enrichkegg=summary(kk)cnetplot(kk, categ
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