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组织特异性转录本示例(绝佳的数据挖掘方向)

生信技能树  · 公众号  ·  · 2019-11-15 12:14
最近一直在推送转录本差异相关的教程,见:每月一生信流程之rnaseqDTU(差异转录本) 扩充了大家对RNA-seq数据的理解,而且也指出来了,严格意义上的转录本定量其实是不容易的,对于二代测序来说:转录本定量本来就不是一件容易的事情 看留言,大家都深有同感!不过好在有三代测序,ISO-seq领域的研究也不少,但是很多朋友对这个差异表达转录本的生物学认识不够,不清楚它的应用领域,恰好看到了一个组织特异性转录本的研究,分析给大家哈;发表在 BMC Genomics的文章 October 2014, IUTA: a tool for effectively detecting differential isoform usage from RNA-Seq data 有一个示例图,非常的说明了转录本表达水平的差异:When applied to actual mouse RNA-Seq datasets from six tissues, IUTA identified 2,073 sign ………………………………

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