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生信学习入门常见错误可能的原因分类总结和求助指南

生信宝典  · 公众号  · 生物  · 2021-01-02 23:33
生信学习学的是什么?常识!学生信,不是贪多的,而是求精的!为前文填坑,也希望能给后续答疑积累个素材,有问题先来查询再提问!文件或目录找不到这是常见问题,常见提示有No such file or directoryError in file(file, “rt”):无法打开链接Fatal error: Unable to open file for reading (seq/WT1_1.fq)Fatal error: Unable to read from file (C:Program file/Git/usearch/rdp_16s_v16_sp.fa)mv: cannot stat ‘circlize.pdf’: No such file or directory排查思路:如果提示中给了文件名,确认与提示名字完全一致的文件是否存在,并确认路径是否正确。如上面第 3 个提示,确认WT1_1.fq文件存在于当前工作路径的 seq 目录下。如果未提示文件名,需要自己从命令行参数中找到文件名,再按第 1 条思路排查不管是哪个情况,要坚信是 ………………………………

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