免疫细胞浸润预后marker思路分享

免疫细胞浸润作为I-III期结肠癌诊断和预后的生物标志物Immune cell infltration as a biomarker for the diagnosis and prognosis of stage I–III colon cancer肿瘤浸润性免疫细胞是可切除结肠癌患者的重要预后信息来源，为了改善结肠癌的早期诊断和预后预测，在研究中采用了通过估计RNA转录物的相对子集的细胞类型鉴定（CIBERSORT），基于公共数据库中可获得的基因表达谱来量化结肠癌患者和正常对照样品中免疫细胞的比例，同时开发了两种新型免疫模型dIRS和pIRS，为结肠癌患者的诊断和预后提供更有效的生物标志物。 材料和方法1.结肠癌数据集和正常对照通过GEO查找数据集，使用affy和simpleaffy包下载并归一化数据的原始CEL值。结肠癌数据集中包括非肿瘤结肠粘膜的mRNA表达谱，这些mRNA数据 ………………………………