TCGA数据库里面的乳腺癌样本RNA-seq数据是配对的有哪些？

大家如果看了我们前面的TCGA数据库系列帖，就应该明白，RNA-seq数据并不是每个患者都会测到其肿瘤组织和正常配对，这个跟找somatic mutation 不一样。伸出我的小脚，将TCGA轻轻绊倒，然后叉腰哈哈笑甜过初恋！这次是真的批量做TCGA的生存分析那么，对于乳腺癌来说，一千多例患者，到底那几个测了配对的正常组织呢？可以用来分析他们哪些呢？下面这篇文章就利用了这些数据，并且下载了TCGA的原始数据，请仔细阅读。灵感来自于 2008和2009年 Venables 做的工作，用传统的RT-PCR 来分析可变剪切Recently, Venables et al. used RT-PCR to screen 600 cancer-associated genes [18] and 2168 alternatively spliced exons (ASEs) [19] in human breast tumors versus normal breast tissues.TCGA数据库的原始fastq数据并不好下载， ………………………………