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3分钟用BLAST设计qPCR 引物!但有个Bug你估计不知道……

实验万事屋  · 公众号  · 科研  · 2020-03-25 08:40
BLAST一般来说,是给你们用来做序列比对的,当然,也能用Primer BLAST做简单的引物验证。所以Primer BLAST其实也能用来做引物设计,这个和Primer 3差不多好用吧。就直接把序列bia进去就行:调整一下所需要的产物片段大小,以及Primer的退火温度,就行了。至于跨内含子……实际上你如果只是bia一段序列的话,是无法选择引物跨内含子的。显示结果,就会展示出给你设计的引物位置:以及序列:当然,你也可以直接输入你需要扩增的片段的登录号,就像这样:由于使用的是片段登录号,所以对序列的注释(外显子位置,CDS等等)都会显示,所以,这里就能选择“跨外显子”设计引物了。为啥引物要跨外显子呢,因为怕qPCR的过程中,会引起DNA污染。一旦一条引物 ………………………………

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