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可能你半天都未必能闹明白这TCGA的神器能干啥用……

实验万事屋  · 公众号  · 科研  · 2020-02-14 08:40
TCGA的分析工具其实有很多,光是昨天讲的文献里,就还包含了cBio这样的常用工具:当然cBio其实很早前就讲过,是对TCGA中的二代测序数据,进行一个可视化的分析,里面会包含样本信息,测序结果,转录组丰都,SNP(Single Nucleotide Polymorphism,单核苷酸多态性)、CNV(Copy Number Variations,拷贝数变异)等等:当然,cBio其实很早前就给你们介绍过了,今天夏老师给你们讲个别的数据库——协调一致的癌症数据库:看到这里,不做肿瘤的盆友就可以关掉了,因为这个数据库,还是和TCGA挂钩的,数据库主要构成是样本和基因。样本主要包含样本具体信息,生存曲线等等,基因呢,则以CNV、突变和多态性为主。比如我们搜一个P53:往下拉,就是P53在各种不同的肿瘤中突变以及拷 ………………………………

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