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ggplot2实现分半小提琴图绘制基因表达谱和免疫得分

生信宝典  · 公众号  · 生物  · 2021-04-13 21:00
最近看到很多人问下面这个图怎么绘制,看着确实不错。于是我查了一些资料,这个图叫split violin或者half violin,本质上是一种小提琴图。参考代码在https://gist.github.com/Karel-Kroeze/746685f5613e01ba820a31e57f87ec87这里利用上期处理好的TCGA HNSCC的配对数据进行练习,数据包含43个肿瘤样本和43个癌旁样本。除了基因表达量绘制的结果展示,最后还附带一个ESTIMATE计算免疫评分的例子。此外,计算免疫浸润主流的方 ………………………………