VSEARCH操作实战-免费使用无内存限制的USEARCH！

前言前面宏基因组公众号号推送过关于USEARCH的介绍及使用，详情见文章：扩增子分析神器USEARCH简介。USEARCH软件在扩增子测序分析上堪称神器！该软件依靠大神Robert Edgar开发的UPARSE,UNOISE等算法，在序列搜索、聚类、去重、去嵌合体等步骤的准确度以及效率上显著高于老牌的mothur,QIIME等软件，受到全世界研究者的喜爱，目前谷歌学术显示其已经被引用了6456次！！USEARCH这个软件的安装以及使用都非常方便，不像QIIME软件一样，“让无数生信人尽折腰”。USEARCH在除了高通量数据处理外，它还提供了α和β(包括unifrac等)多样性分析，可以说功能非常全面！进入官网USEARCH我们可以看到作者提供32位的免费版本和64位的收费版本。免费提供的32位版本限制用户最多使用4G内存，依照本人样本的数据量以及使用经验的话，大于40个样品可能就不能有效的跑完全部流 ………………………………