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肿瘤经典数据库Oncomine,肿瘤研究的万金油,看这篇就够了

挑圈联靠  · 公众号  ·  · 2020-11-14 12:43
Oncomine也是肿瘤领域中一个经典的样本数据库,能帮助我们筛选一些值得研究的靶分子,或预测表型。为什么说“也”呢?因为它和咱们之前讨论过的TCGA一样,都是肿瘤领域应用较广的数据库。不过Oncomine和TCGA相比的优势就是,它除了数据,还提供了一些简洁易操作的分析工具,如差异表达分析、共表达分析等,分析后可以直接出图用在文章里。另外它还整合了TCGA和GEO的部分数据。缺点是,免费版的数据不能下载,收费又天价。不过办法还是有的,先卖个关子。TCGA的优点就是维度较高,层次很丰富,缺点就是不提供分析工具,得另找或另学。这里就不说这么多了,大家可以根据自己的情况选用。今天我们单讲Oncomine。Oncomine的应用场景要说应用,倒和TCGA差不多,主要 ………………………………

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