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李婧翌团队对单细胞RNA测序中的双细胞识别方法进行系统性评测研究

BioArt  · 公众号  · 生物  · 2021-01-31 10:19
责编 | 兮在单细胞RNA测序(scRNA-seq)实验中,如果一个反应体(reaction volumn)恰好包含了两个细胞,就会形成双细胞(doublets)。由于双细胞并不是真正的细胞,它们的存在会严重干扰对单细胞RNA测序数据的分析。近年来,研究人员开发了一些计算方法来识别单细胞RNA测序数据中的双细胞。但是,该领域内缺少对这些方法的全面评测研究,从而使下游用户难以根据自身需求选择合适的识别方法。近日,加州大学洛杉矶分校(UCLA)的李婧翌团队在 Cell Systems 杂志发表了题为 Benchmarking computational doublet-detection methods for single-cell RNA sequencing data 的论文【1】,首次对单细胞RNA测序领域内的9种识别双细胞的计算方法进行了系统性的评测研究。作者收集整理了16套包含双细胞实验 ………………………………

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