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热点基因集生信分析四种起手式,你肯定不知道

生信人  · 公众号  · 生物  · 2024-04-23 07:00
书接上回提到利用临床表型数据库计算相关性,然后孟德尔随机计算因果之后,再利用生物信息分析进行机制的探究和挖掘。目前还不需要很复杂的挖掘,对于感兴趣的基因集,之前小编介绍过两种分析路线。小编把话放在这哈,这个思路,仍旧是干湿结合发文章,申请课题的最优的方案。(钱少事少内容多)今天有三种给大家推荐下。一、lasso+cox第一个就是之前反反复复,复复反反推荐过的技术路线,主要用于基因数量比较多的情况下,比如铁死亡基因集。数量较多,从数据流动性上看,存在降维的可能性,后续存在被实验验证的可能性。Ref:Front Immunol IF:7.3 2022二、一致性聚类+差异分析+lasso+cox如果说lasso+cox是针对基因集多的情况,那么这个一致性聚类针对的就是基因集比较少的情况,基因数量少。可能的原因在于目前的基因并不是全部,可 ………………………………

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