【生信文献200篇】07 时间序列单细胞转录组数据分析

00 文献信息英文标题：Optimal-Transport Analysis of Single-Cell Gene Expression Identifies Developmental Trajectories in Reprogramming中文标题：对单细胞基因表达的最佳转运分析确定了重编程的发展轨迹期刊：《Cell》影响因子：38.637 发表时间：2019-01-31研究领域：单细胞DOI号：10.1016/j.cell.2019.01.00601 概述In BriefApplication of a new analytical approach to examine developmental trajectories of single cells offers insight into how paracrine interactions shape reprogramming.研究人员对315000个单细胞(在小鼠成纤维细胞重编程为iPSC的过程中，每隔6～12小时收集一次样品，共持续了18天)进行大规模RNA测序并解析了测序结果。利用Waddington-OT将不同时间点的细胞类型和细胞分布进行关联，成功追溯了从成纤维细胞到iPSC重编程过程中细胞变化 ………………………………