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简单点的信号通路数据库,这估计你们应该用得上了吧……

实验万事屋  · 公众号  · 科研  · 2020-10-29 07:27
讲逻辑太沉重,还是讲讲信号通路工具来调剂一下哈。其实仿佛几年前给你们讲过Pathway Commons,但现在再来看看,感觉已经不太一样了(现在想想一个能维持运营几年的工具,应该还不算差了)。比如这个常用的工具PathViz就直接在首页上显示了:输入一个或者多个基因,就能形成他们之间的Pathway关联网络图,比如P53和MDM2:在Node间的Edge上,点击一下,就能显示两者关联的具体方式以及相关文献:当然,PathViz只是Pathway Commons的一个工具,Pathway Commons主要的功能还是搜信号通路,比如我们还是搜一个P53:也一样是这样的network图:但具体的调控就变得更加细化了:点击后就是一长串的文献证据:或者只是点击含有P53的信号通路图,比如P53调控P21表达,就是这样的:在步骤 ………………………………

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